板式換熱器根據不同情況，可采用不同的處理方法，來對換熱器維修及維護。
如設備無漏水，只是換熱系統K值降低，則不需拆開換熱器，而是用一個閉路系統將除垢液注入設備內循環數小時即可。場地無此條件，且拆開設備發現結垢不太嚴重時，可不需取下板材，直接用水沖洗，同時用軟刷刷刷即可。
一、換熱器日常維護
需要維修的設備，應按逆安裝順序拆開換熱器；
在石油、化工等行業中使用的設備，要按檢修周期定期進行維護保養；
設備內的介質如為易燃、易爆或有腐蝕性的介質，每年至少要進行一次檢修；
其他行業使用的板式換熱器，如無漏水現象，最好在三年內維修一次；
二、換熱器板材的清潔與防護
保潔板的清潔是保證高傳熱系數的一個重要條件。薄板間介質沿狹長彎曲的流道流動，即使形成不太厚的垢層，也會引起流道的變化，對流體運動有很大的影響，使壓力降增大，換熱系數降低。如某制糖企業在供暖時采用了板式換熱器，由于二次水處理不好，在使用過程中僅兩個月就將整個流道堵塞，無法繼續使用。
1、化學清洗方法。
該方法是通過熱交換器循環將化學溶液溶解在片材表面的額污垢中，并將其排出。此方法無需拆開熱交換器，簡化了清洗過程，減輕了工人的勞動強度。片狀波紋可促進清洗液的劇烈紊流，有利于垢層溶解，化學清洗法是較為理想的清洗方法。
2、機械(后勤)清潔法。
本方法是將片材拆開后，用刷子進行人工清洗，以達到清洗片材表面污垢的目的。這種方法雖然比較直接，但是對于較硬、較厚的垢層，清洗很難。
3、綜合洗滌法。
對垢層較厚、較硬的情況，單獨使用上述方法是很難清潔干凈的。綜合洗滌法是先用化學洗滌法軟化垢層，然后用機械(物理)洗滌法去除垢層，以保持板材表面干凈。
4、是清洗時的注意事項。
a、化學清洗時，溶液應保持一定的流動速度，一般為0.8~1.2m/s.其目的是為了增加溶液的紊流程度。
b、針對各種污垢使用的化學洗滌劑。除常用的純堿稀釋液外，對水垢可用5%硝酸溶液。堿法生產產生的水垢，可用5%鹽酸溶液處理。但是，不要使用會腐蝕片材的化學清洗劑。
c、機械(物流)清洗不銹鋼片材時，不得用碳鋼刷刷刷不銹鋼片材，以免加速片材的腐蝕。與此同時，板面不能有劃痕，變形等現象。洗凈的板片要用清水洗凈并擦干，放置時要防止板片變形。
三、墊片的性能特點及其更換
隨著板式換熱器應用領域的不斷擴大，對不同介質和工藝的耐溫、耐壓、耐腐蝕要求也不同。很明顯，要用一個“萬能”的墊片來適應所有情況是不可能的，而要根據不同情況使用不同材料的墊片。墊圈的斷面形狀通常是六角。普通墊片主要有天然橡膠，氯丁橡膠，丁晴橡膠，三元乙丙橡膠，硅橡膠，氟橡膠，石棉纖維板等。
板式熱交換器在使用過程中，如出現滲漏、斷裂、老化等現象，應及時更換。替換必須以下列順序進行：
拆除廢棄墊片。拆下時，注意不要在墊片槽內留下劃痕；
用丙酮，丁酮或其他酮類溶劑，將墊片槽內殘膠清除干凈；
用干凈的布或棉紗把墊圈和墊圈擦干凈；
將膠粘劑均勻地涂在墊圈槽內；
把干凈的新墊片貼到板子上；
貼好墊片的板材應放置在平坦、陰涼、通風處，并自然干固4h后即可安裝使用。