一、機械除垢清洗法
當管殼式換熱器的管束有輕微的堵塞或積渣垢時，可采用不銹鋼鋼條或低碳銅盤從一端通到另一端拔出，以清除輕微的堵塞或積渣垢。輕、細的積垢，可根據管徑選擇專用清管刷，一頭穿粗鐵絲，將清管刷從換熱管內拉出，反復幾次即可清除與換熱管結合不太緊的積垢。如果管子內垢較重或完全堵塞，可用軟質金屬刺管清除。管道的管口被污垢或異物堵塞時，可采用鏟除、削、刮、刷等人工方法進行處理。
二、用高壓水的沖洗和清洗
高電壓水洗是利用高壓水泵打出的高電壓水，通過專用清洗槍將高電壓水直接注入到需要清洗的部位，其調壓范圍為0~100MPa。若水垢不太緊，可選用40MPa左右的壓力。在結構堅固、緊密時，也可將高合金噴頭塞進管子中進行高壓清洗，一般這種方法主要是用來清洗管殼式換熱器的管內垢層，或用來清洗可抽出管束的熱交換器設備外殼和管束表面的垢、異物，例如U形管換熱器的清洗過程：
(1)清潔工應穿戴勞保用品；
(2)根據設備自身情況合理調整水壓，注意人身和設備的安全；
(3)水槍試驗；
(4)對換熱器管、殼程進行清洗，如設備封頭已拆開，清洗過程中水槍噴射方向應設警戒區，并有專人看守。
三、化學溶劑除垢法
先對結垢物質進行化學分析，然后決定用哪種溶劑清洗。普通硫酸鹽和硅酸鹽水垢一般采用堿洗，碳酸鹽水垢則采用酸洗，油垢的結焦可用氫氧化鈉、碳酸鈉、洗衣粉、洗滌劑等按一定比例配水清洗。使用化學清洗必須考慮使用防腐劑。在進行化學清洗之后，再用清水循環沖洗幾次，直到水變成中性。除了上述清洗方法外，本機還可采用海綿球自動清洗。